1. 肝病专科
对各种原因引起的肝脏损害有丰富的诊治经验。开展了对慢性乙型、丙型肝炎有特色的抗病毒治疗，对乙肝病毒变异处理有特色的治疗方法；对肝纤维化、肝硬化及其并发症的诊治有突出的手段；对原发性肝癌的早期诊断及治疗有丰富的临床经验。对晚期肝癌的综合疗法减轻了病人的晚期痛苦，延长了病人的生存期。肝病科在重症肝炎的抢救中有特色的治疗方法，采用抗病毒治疗联合人工肝支持系统抢救乙肝病毒引起的重型肝炎、肾上腺皮质激素联合人工肝支持系统抢救急性亚急性重型肝炎，疗效显著。开展肝活体组织检查在疑难肝病及抗病毒治疗疗效判断中的应用，提高肝病诊断及治疗技术水平。肝病专科在乙型肝炎发病的免疫发病机制做了系统的研究。
2. 结核专科
我科是南京市结核病定点诊疗机构。对肺结核及肺外结核病的诊治具有丰富的经验。开设结核病预防门诊为高危人群提供结核病潜伏感染筛查及预防性治疗。在历年的结核病的专项检查中在全省排名名列前茅。得到了市、区卫生主管部门的奖励。
3.艾滋病专科
我科是南京市艾滋病定点诊疗机构。负责对辖区内艾滋病患者的长期治疗、监测及管理工作。多次得到了市、区卫生主管部门的表彰。
4. 急性感染病专科 对各种传染病的防治有规范的隔离病房、严格的消毒隔离制度、规范化的诊治流程、精湛的传染病防治技术，对各种烈性传染病的诊治，尤其对不明原因发热，积累了丰富的临床经验。近年来为本地区传染病防控工作作出了巨大贡献。